細菌性では大腸菌が原因菌であることが最も多いです。

男性の尿道は約20cmであるのに対し、女性の尿道は5cm程度であり、更に尿道口と膣・肛門の距離が男性よりも近いために、男性より多くの細菌等が侵入しやすく、女性に多くみられます。

細菌が侵入しただけでは膀胱炎とはならず、膀胱内で細菌が増殖し、炎症をきたすと膀胱炎となります。

「トイレを我慢すると膀胱炎なる」とよく言われますが、それは長時間尿が膀胱内に留まることで細菌が増殖しやすいためです。

また、性交渉、特に口腔性交は尿道に細菌が入り込むリスクが高くなります。

ステロイド内服や糖尿病、他にもストレスや冷えで抵抗力が弱まっている場合にも、膀胱炎になりやすいです。

細菌感染以外では、単純ヘルペスウイルス、カンジダ(真菌)が原因となることがありますが、これらは免疫力が低下している場合に発生することがほとんどです。

トリコモナス症という性感染症では、黄緑色の膣分泌物が大量に出て、尿道口から膀胱に感染してしまう場合もあります。

複雑性膀胱炎の場合は他の病気と合併していたり、あるいはステロイドや抗がん剤等の治療中に免疫力が低下することで生じます。特に多くみられるのが、尿管結石や糖尿病、前立腺肥大、がんや膠原病です。子どもの場合は尿路の先天異常が原因として多く見られます。

血尿が起きている場合には出血性膀胱炎が疑われます。

ウイルス、抗がん剤などの薬剤、放射線などが原因として挙げられます。

間質性膀胱炎は、細菌の感染はなく、原因不明です。尿が膀胱の粘膜が弱まり、粘膜の細胞と細胞の間が炎症を起こします。膀胱の痛みがひどく、膀胱が萎縮してしまうこともあります。

真菌性膀胱炎はカビを原因とした膀胱炎です。発熱や腎機能低下がみられ、カンジダ属の真菌によるものが多いです。免疫力が低下している人や、膀胱留置カテーテルを長期間使用している人にしばしば発生します。